초대방주교회의 중점 선교사역은 해외선교지역 교회건축 및 선교사 후원과 국내 심장재단 후원에서 해외 어린아이들을 후원하는 것으로 방향을 전환하였습니다. 현재는 월드비젼과 초록우산등을 통해 국내외 어린아이들을 후원하고 있는데, 해 마다 후원하는 아이들을 조금씩 조금씩 확대해 나갈 계획을 가지고 있습니다. 현재 후원국은 보스니아, 케냐, 스리랑카, 베트남, 우즈베키스탄 등을 후원하고 있으며, 국내선교는 지적 장애자들을 돌보는 특수목회 교회를 후원하고 있습니다.